La Fondation Folon est une institution muséale et possède sa propre collection. Comme telle, elle acquiert, conserve, étudie, expose et transmet cet exceptionnel patrimoine au public.
Elle protège l’image de Jean-Michel Folon et gère les droits liés à son œuvre.
Enfin, elle a à cœur de poursuivre les valeurs chères à l’artiste. Celles-ci sont au centre de son objet social. Perpétuant le souhait de Folon, elle accueille chaque année de nombreux visiteurs rencontrant des fragilités mentales ou physiques pour qui la visite est gratuite et adaptée. Elle continue le travail mené de concert par Amnesty International et Folon en ce qui concerne la défense des droits humains, en rééditant régulièrement la Déclaration et en versant les bénéfices à cette association.